生物分类学

关于如何为生物命名的原则有很多国际协议，例如《国际植物命名法规》（，简称ICBN）、《国际动物命名法规》（International Code of Zoological Nomenclature，简称ICZN）以及《国际细菌命名法规》（International Code of Nomenclature of Bacteria，简称ICNB）。第四版的生物命名法规（BioCode）草案在2000年出版，它试图在5个领域标准化命名，但现在还没有被正式采纳。《国际病毒命名和分类法规》（International Code of Virus Classification and Nomenclature，简称ICVCN）是属于生物命名法规的。

传统上，生物分为五界(kingdom)，

• 原核生物界(bacteria) -- 原生生物界(protista) -- 真菌界(fungus) -- 植物界(plant) -- 动物界(animal)

Copeland提出过四界说：

• 原核生物界 -- 原生生物界 -- 植物界 -- 动物界

也有人使用三域系統说。这种分类方法反映了细胞是否有核以及细胞膜和细胞壁的差异。

• 古菌域(archaea) -- 细菌域(bacteria) -- 真核域(eukaryota)

另有一些不属于上述所有分类的介于生物和非生物之间的生命形式，即只能寄生于细胞内的病毒，而它们在细胞外并不表现出活跃的生命形式。

• 病毒 -- 类病毒 -- 朊病毒

这个列表以NCBI Taxonomy上的分類爲基礎。

• 古菌分類表
• 細菌分類表
• 植物分類表 (NCBI)
• 动物分类表
• 真菌分类表
• 原生生物分类表

包含嗜鹽菌、一些超嗜熱菌、嗜酸菌等。

包含放線菌、衣原體、支原體、立克次體等。

包含綠藻、輪藻、苔蘚植物、蕨類植物、種子植物等。

真菌/後生動物組除動物界和真菌外，還包含領鞭毛蟲、魚醉菌等。

即“後生動物”組。

包括子囊菌、擔子菌、接合菌、壺菌、聚合菌和微孢子蟲。

真核生物除動物、植物、真菌三界之外統稱原生生物，爲併系群。

• 等輻骨蟲綱（Acantharea），如等棘蟲。
• 放射蟲綱
• 雙滴蟲類（Diplomonadida），如曲滴蟲、賈第蟲。
• Parabasalidea
  • 毛滴蟲綱（Trichomonada）
  • 超鞭毛綱（Hypermastigia）
• 異葉足綱（Heterolobosea），如集胞菌。
• 眼蟲門
  • 動質體目（Kinetoplastida）
  • 眼蟲綱
• 隱藻綱（Cryptophyta）
• 定鞭藻綱（Haptophyceae），如球石藻、等鞭金藻、棕囊藻。
• 不等鞭毛類，除下列分類還包括輻球蟲、蛙片蟲等。
  • 金藻綱
  • 硅鞭藻綱（Dictyochophyceae）
  • 針胞藻綱（Raphidophyceae）
  • 前毛壺菌綱（Hyphochytriomycetes）
  • 卵菌綱
  • 褐藻門，如海帶、巨藻、馬尾藻、墨角藻。
  • 硅藻門
  • 黃藻門
• 囊泡蟲類
  • 頂複門，如瘧原蟲。
  • 纖毛蟲類，如喇叭蟲、中縊蟲、榴彈蟲、草履蟲、四膜蟲。
  • 甲藻門
• 單孢子蟲門（Haplosporidia）
• 絲足蟲類
• 根腫菌類（Plasmodiophorida）
• 粒網足蟲類（Granuloreticulosea），如有孔蟲。
• 葉足綱（Lobosea），如變形蟲（阿米巴）。
• 黏菌門
• 灰胞藻綱（Glaucocystophyceae）
• 紅藻門，如石花菜、紫菜。

註：以上真核生物列表不完全，尚包括有其他一些未歸類原生生物。

• 进化生物学、系统生物学
• 亚里士多德：《工具论》
• 林奈：双名法